Chuyển thể từ cuốn tự truyện cùng tên của nhà văn nổi tiếng Tetsuko Kuroyanagi, Totto-Chan: Cô Bé Bên Cửa Sổ là câu chuyện đầy cảm động về Totto-Chan, một cô bé 6 tuổi với trí tưởng tượng phong phú và trái tim nhân hậu. Bị đuổi học vì sự khác biệt, Totto-Chan tìm đến Trường Tomoe, nơi những điều kỳ diệu bắt đầu nảy nở. Tại đây, Totto-Chan được học tập và vui chơi trong một môi trường hoàn toàn khác biệt so với những trường học thông thường. Thay vì những quy tắc cứng nhắc và áp lực học tập, Totto-Chan được khuyến khích khám phá thế giới xung quanh bằng chính đôi mắt và trái tim của mình. Dưới sự dẫn dắt của thầy hiệu trưởng Kobayashi đầy yêu thương và những người bạn độc đáo, Totto-Chan trải qua những ngày tháng tuổi thơ vô cùng ý nghĩa.